De Lutherse Kerk is eigendom van de Evangelische Lutherse Gemeente Groningen. De exploitatie van het kerkgebouw wordt verzorgd door Stichting Exploitatie Lutherse Kerk in samenwerking met de Stichting Martinikerk Groningen. De kerk is één van de ‘Binnenstadskerken Groningen’, drie historische kerken in het centrum van Groningen die een nauwe samenwerking hebben, o.a. op het gebied van de verhuur.